Lyseo-seuran tarkoituksena on edistää ja ylläpitää Joensuun Lyseon, Joensuun Tyttölyseon ja Joensuun lyseon lukion vahvoja sivistysperinteitä ja nykykoulun yleissivistävää opetus- ja kasvatustyötä ja antaa tälle työlle mahdollisimman laajaa myönteistä tunnettavuutta. Yhdistyksen tarkoituksena on samalla jatkaa Joensuun Lyseon ja Tyttölyseon entisten oppilaiden yhdistysten perinteitä sekä ylläpitää harrastusta entisiä kouluja kohtaan.