Vuoden 2001 alusta käynnistyi ISVY:n kolme opetushanketta: ympäristötekniikka, sovellettu matematiikka ja tilastomatematiikka sekä tietojenkäsittelytiede. Neljäs opetushanke, kauppatiede käynnistyi marraskuussa 2001. Opetushankkeiden tavoitteena oli yhdistää kolmen yliopiston resurssit Itä-Suomen alueella.

Itä-Suomen virtuaaliyliopiston opetushankkeet 2001-2004:

Ympäristötekniikka

Sovellettu matematiikka ja tilastomatematiikka

Tietojenkäsittelytiede

Kauppatiede